Re: Psi genom, ludzki genom
: wtorek 22 sty 2013, 00:08
Jeszcze o locus E – allel E^g (grizzle)
Na początku chcę nadmienić, że teraz będę stosować trochę zmieniony zapis układu dwóch alleli w danym locus. Allele te będą oddzielone od siebie ukośną kreską.
Jak wcześniej pisałam, w locus E może znajdować się też sekwencja będąca w interakcji z locus A, która modyfikuje układ alleli a^t /a^t. I jest taka sekwencja. Została ona opisana w roku 2010 ale zdołano ją wyodrębnić na razie tylko u dwóch ras, u charta perskiego – saluki i u charta afgańskiego. Ta mutacja w locus E (która mutuje również produkt MC1R) daje w fenotypie zmodyfikowane umaszczenie czarny/brązowy podpalany, zwane umaszczeniem grizzle. Pojawia się już w momencie narodzin i pozostaje przez całe życie.
Hierarchia dominacji alleli w locus E będzie teraz wyglądać następująco : E^m>E^g>E>e.
Allel E^g (grizzle) jest postrzegany jako modyfikator allelu a^t (tak jak allel H jest postrzegany jako modyfikator allelu M). Są to ciemniejsze nakładki obejmujące wierzch głowy, grzbiet, boki, wierzch ogona i zewnętrzną część kończyn. Umaszczenie to daje charakterystyczny wzór na głowie – ciemniejszą „przepaskę” na szczycie głowy, która przechodzi między oczami w cienką, podłużną linię. Jakkolwiek grizzle znaczy szary/siwy to nakładki te mogą być czarne, szare, brązowe o różnej intensywności. Spód psa, pysk i jego nogi od wewnątrz są w jaśniejszym kolorze ( różne wysycenie i odcienie czerwonego, rudego, żółtego).
Aby powstało takie umaszczenie to musi być :
w locus E : co najmniej jeden allel E^g (E^g/_ ); układ ten nie blokuje ekspresji alleli w innych loci.
w locus K : homozygotyczny, recesywny układ k/k; allele w locus A nie będą zablokowane.
W locus A : układ homozygotyczny a^t /a^t.
W miejsce _ można wstawić ten sam allel lub allel bardziej recesywny od niego.
A teraz zapiszmy częściowy genotyp saluki o umaszczeniu grizzle :
…..., E^g/_ , k/k, a^t /a^t, ......
Są to niezbędne układy alleli aby powstało takie umaszczenie. Nie ma w nim, między innymi, alleli wpływających na intensywność lub rozmycie eu- i feomelaniny.
…..., B/_, D/_, E^g/_ , k/k, a^t /a^t, ......
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiFlame.jpg
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiGlitz.jpg
Jeżeli w genotypie saluki w locus E zamiast E^g wystąpią allele E^m, E, e oraz równocześnie w locus A wystąpi układ a^t/a^t, to umaszczenie grizzli nie powstanie. Będzie to tylko czarny/brązowy podpalany (poza przypadkiem kiedy w locus E będzie układ e/e).
…..,B/_ , D/_, E/_ , k/k, a^t /a^t, …...
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiOasis.jpg
A jeżeli w locus E będzie układ E^g/_ a w locus A układ a^y/ _ (a więc inny niż a^t /a^t ) - to umaszczenie grizzle również się nie pojawi. Taki pies będzie w jakimś odcieniu
żółtym/rudym/czerwonym z ewentualnym ciemniejszym nalotem na końcówkach włosów
….., E^g /e , k/k, a^y/ _ , .....
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiSimba.jpg
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiChief.jpg
….., E/E , k/k, a^y/ _ , .....
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiAli.jpg
Umaszczenie grizzle to nie jedyne umaszczenie występujące u chartów perskich. Jest ich znacznie więcej. Zainteresowanych odsyłam do stron na których można obejrzeć wiele zdjęć tych psów :
http://www.saluki.se/index.php?option=c ... &Itemid=73
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiColor.html
Allelowi E^g poświęciłam trochę więcej uwagi ze względu na to iż to w tym locus może (choć wcale nie musi) znajdować się modyfikator powodujący pełzanie czarnego/brązowego podpalanego w kierunku czapraka. Na razie poznano tylko modyfikator ukierunkowujący to pełzanie w kierunku grizzle i to występujący w dwóch rasach. Modyfikator „czaprakowy” dalej czeka na odkrycie.
U charta afgańskiego obecność allelu E^g daje bardzo podobny typ umaszczenia jak u saluki ale nie nazywa się ono grizzle tylko domino. http://homepage.usask.ca/~schmutz/Afghans.html" onclick="window.open(this.href);return false;
Na początku chcę nadmienić, że teraz będę stosować trochę zmieniony zapis układu dwóch alleli w danym locus. Allele te będą oddzielone od siebie ukośną kreską.
Jak wcześniej pisałam, w locus E może znajdować się też sekwencja będąca w interakcji z locus A, która modyfikuje układ alleli a^t /a^t. I jest taka sekwencja. Została ona opisana w roku 2010 ale zdołano ją wyodrębnić na razie tylko u dwóch ras, u charta perskiego – saluki i u charta afgańskiego. Ta mutacja w locus E (która mutuje również produkt MC1R) daje w fenotypie zmodyfikowane umaszczenie czarny/brązowy podpalany, zwane umaszczeniem grizzle. Pojawia się już w momencie narodzin i pozostaje przez całe życie.
Hierarchia dominacji alleli w locus E będzie teraz wyglądać następująco : E^m>E^g>E>e.
Allel E^g (grizzle) jest postrzegany jako modyfikator allelu a^t (tak jak allel H jest postrzegany jako modyfikator allelu M). Są to ciemniejsze nakładki obejmujące wierzch głowy, grzbiet, boki, wierzch ogona i zewnętrzną część kończyn. Umaszczenie to daje charakterystyczny wzór na głowie – ciemniejszą „przepaskę” na szczycie głowy, która przechodzi między oczami w cienką, podłużną linię. Jakkolwiek grizzle znaczy szary/siwy to nakładki te mogą być czarne, szare, brązowe o różnej intensywności. Spód psa, pysk i jego nogi od wewnątrz są w jaśniejszym kolorze ( różne wysycenie i odcienie czerwonego, rudego, żółtego).
Aby powstało takie umaszczenie to musi być :
w locus E : co najmniej jeden allel E^g (E^g/_ ); układ ten nie blokuje ekspresji alleli w innych loci.
w locus K : homozygotyczny, recesywny układ k/k; allele w locus A nie będą zablokowane.
W locus A : układ homozygotyczny a^t /a^t.
W miejsce _ można wstawić ten sam allel lub allel bardziej recesywny od niego.
A teraz zapiszmy częściowy genotyp saluki o umaszczeniu grizzle :
…..., E^g/_ , k/k, a^t /a^t, ......
Są to niezbędne układy alleli aby powstało takie umaszczenie. Nie ma w nim, między innymi, alleli wpływających na intensywność lub rozmycie eu- i feomelaniny.
…..., B/_, D/_, E^g/_ , k/k, a^t /a^t, ......
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiFlame.jpg
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiGlitz.jpg
Jeżeli w genotypie saluki w locus E zamiast E^g wystąpią allele E^m, E, e oraz równocześnie w locus A wystąpi układ a^t/a^t, to umaszczenie grizzli nie powstanie. Będzie to tylko czarny/brązowy podpalany (poza przypadkiem kiedy w locus E będzie układ e/e).
…..,B/_ , D/_, E/_ , k/k, a^t /a^t, …...
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiOasis.jpg
A jeżeli w locus E będzie układ E^g/_ a w locus A układ a^y/ _ (a więc inny niż a^t /a^t ) - to umaszczenie grizzle również się nie pojawi. Taki pies będzie w jakimś odcieniu
żółtym/rudym/czerwonym z ewentualnym ciemniejszym nalotem na końcówkach włosów
….., E^g /e , k/k, a^y/ _ , .....
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiSimba.jpg
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiChief.jpg
….., E/E , k/k, a^y/ _ , .....
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiAli.jpg
Umaszczenie grizzle to nie jedyne umaszczenie występujące u chartów perskich. Jest ich znacznie więcej. Zainteresowanych odsyłam do stron na których można obejrzeć wiele zdjęć tych psów :
http://www.saluki.se/index.php?option=c ... &Itemid=73
http://homepage.usask.ca/~schmutz/SalukiColor.html
Allelowi E^g poświęciłam trochę więcej uwagi ze względu na to iż to w tym locus może (choć wcale nie musi) znajdować się modyfikator powodujący pełzanie czarnego/brązowego podpalanego w kierunku czapraka. Na razie poznano tylko modyfikator ukierunkowujący to pełzanie w kierunku grizzle i to występujący w dwóch rasach. Modyfikator „czaprakowy” dalej czeka na odkrycie.
U charta afgańskiego obecność allelu E^g daje bardzo podobny typ umaszczenia jak u saluki ale nie nazywa się ono grizzle tylko domino. http://homepage.usask.ca/~schmutz/Afghans.html" onclick="window.open(this.href);return false;